WWF ghi nhận 6 vùng sinh thái ưu tiên toàn cầu
Ngoại trừ vùng Đồng bằng Sông Cửu Long, các vùng sinh thái ưu tiên chủ yếu ở các cảnh quan rừng núi, lưu vực đầu nguồn các hệ thống sông lớn ở Việt Nam.
Vùng sinh thái ưu tiên toàn cầu đầu tiên là rừng ẩm trên dãy Trường Sơn. Vùng này chủ yếu phân bố ở vùng núi Bắc Trung Bộ và Nam Trung Bộ. Đây là khu vực có thảm rừng kín nhiệt đới thường xanh. Trong đó, còn nhiều diện tích rừng nguyên sinh. Khu hệ động vật hoang dã rất phong phú với nhiều loài thú mới được phát hiện.
Rừng khô Đông Dương chủ đạo là rừng khộp, phân bố chủ yếu ở các tỉnh ở Tây Nguyên và một phần Đông Nam Bộ.
Vùng hạ lưu sông Mêkông chủ đạo là rừng trên đất ngập nước, gồm rừng tràm trên đất than bùn, rừng ngập mặn ở các cùng cửa sông ven biển thuộc vùng đồng bằng sông Cửu Long.
Rừng ẩm á nhiệt đới Bắc Đông Dương phân bố chủ yếu ở các vùng núi cao vùng lưu vực hệ thống sông Hồng, sông Đà ở vùng Tây Bắc trên dãy Hoàng Liên và một phần vùng núi cao Đông Bắc, kéo dài tới tây Nghệ An với hệ động, thực vật rất phong phú và đa dạng.
Rừng ẩm Đông Nam Trung Quốc - Hải Nam phân bố chủ yếu ở vùng Đông Bắc thuộc vùng lưu vực các sông Lô, Gâm, Chảy.
Sông, suối Tây Giang (sông Bằng - Kỳ Cùng) phân bố chủ yếu ở các tỉnh Cao Bằng, Lạng Sơn với các sông, suối thuộc hệ thống sông Tây Giang (Trung Quốc). Tại sông Bằng, đã xác định có nhiều loài trai, ốc đặc hữu, phân bố hẹp, được ghi trong Sách đỏ Việt Nam năm 2007.
